Fait souvent oublié : auparavant, le premier lieu d’implantation de la communauté fut le château d'Echallens où s'ouvrit un hôpital pour déshérités. Une arrivée diversement appréciée, notamment en raison du contexte historique. On se méfiait particulièrement du pasteur Louis Germond, le fondateur de l'oeuvre, parce qu'il faisait partie des Libristes, ces ministres vaudois qui refusèrent une intégration de l'Eglise à l'Etat.

Ainsi, après des mois de guerre larvée, le pasteur Germond dut regagner sa commune d'origine entre deux gendarmes et les diaconesses cesser toute activité. L'infirmerie de la communauté ouvrira à nouveau en 1850 au château pour déménager deux ans plus tard – et définitivement - à Pompaples, lieu qui doit son nom à l'ermite Saint Lupicin, frère de St Romain, fondateur de Romainmôtier.