A ses yeux, cette initiative « discrimine et diffame les musulmans », « contrevient aux droits fondamentaux et aux droits de l’homme », « attise les craintes et crée l’insécurité », et constitue « un obstacle à l’intégration ». Dans son communiqué de presse, la CFR considère que les musulmans, troisième communauté religieuse de Suisse, ne doiventt pas être relégués « dans des lieux de prière cachés dans des garages ou des arrière-salles ». Elle souhaite que soient trouvée une forme adéquate pour les musulmans de vivre leur foi au sein de la société suisse, tout en rappelant que « les dispositions du droit de la construction devraient s’appliquer de la même manière pour tous ». La CFR est une commission extraparlementaire instituée par le Conseil fédéral, destinée à éliminer toute forme de discrimination raciale et promouvoir une meilleure entente entre les cultures. Des représentants des communautés religieuses en sont membres en qualité d’experts.